國家稅務局系統(tǒng)由國家稅務總局垂直領導;省級地方稅務局受省級人民政府和國家稅務總局雙重領導，省級以下地方稅務局系統(tǒng)由省級地方稅務機關垂直領導。因此，國家稅務局系統(tǒng)和地方稅務局系統(tǒng)分屬國家不同的職能部門，一般是分開辦公的，但是，也由一些地方的國家稅務局系統(tǒng)和地方稅務局系統(tǒng)是合署辦公的。

國稅局系統(tǒng)：增值稅，消費稅，車輛購置稅，鐵道部門、各銀行總行、各保險總公司集中繳納的營業(yè)稅、所得稅、城市建設維護稅，中央企業(yè)繳納的所得稅，中央與地方所屬企業(yè)、事業(yè)單位組成的聯(lián)營企業(yè)、股份制企業(yè)繳納的所得稅，地方銀行、非銀行金融企業(yè)繳納的所得稅，海洋石油企業(yè)繳納的所得稅、資源稅，外商投資企業(yè)和外國企業(yè)所得稅，證券交易稅(開征之前為對證券交易征收的印花稅)，個人所得稅中對儲蓄存款利息所得征收的部分，中央稅的滯納金、補稅、罰款。